使用沸水浸泡是清除蔬菜中农药残留的有效方法。刚采摘或刚购买的蔬菜，尤其是瓜果类，在冰箱冷藏3至5天后食用，能显著减少农药残留。对于容易腐烂的蔬菜，多次用水冲洗也能降低有害物质的残留量。
“一洗二泡三烫四弃”是公认的清除蔬菜农药残留的有效方法。先用水清洗，再泡在清水中一段时间，然后在锅里烫几分钟，最后倒掉烫菜的水。实验显示，这种方法可清除80%至90%的残留农药。但这种方法会丢失大量水溶性维生素及无机盐。
预防医学科学院专家提供了一种简易方法。洗水果时，多用清水浸泡，先冲洗表面污物，再用清水浸泡10分钟以上。必要时可加入果蔬清洗剂。清洗2至3次后，大部分残留农药可被清除。对于叶菜和花类蔬菜，用清水多次清洗是有效方法。
对有皮的水果，去皮食用可增加安全性，虽然会损失一些皮中的营养。烫煮蔬菜如青椒、菜花、豆角、芹菜等，先用开水烫一下，可清除90%的残毒。
对于某些适合储存保管的果品，购回后存放一段时间，农药残留可在空气中缓慢分解为对人体无害的物质。因此，将适合储存的水果存放一段时间，也能减少农药残留量。
